Автор

как настроить задний переключатель Deore 590 который работал с кассетой 8ск на 9ск после замены кассеты и цепи на 9 ?(+ менялась манетка)

Так же как и раньше. 9 передача, натянуть и зажать трос

Автор

так и сделал только включаются не все передачи, переключение не чёткое

если нет претензий к ровности петуха, тросу и рубашке, то возможно дело в манетке.